今天的AI已经非常会回答科学问题了，但它能完成一次真实的药物研发任务吗?

　　9月22-24日，在阿里举办的2026云栖大会上，MolVortex回答了这个问题。MolVortex是望石智慧全新首发的全栈式小分子医药早研智能体，产品研发负责人付冬在发布时表示，MolVortex立足于打造医药垂直领域里真正具有研发能力、能够切入研发决策的AI Scientist。其能够完整覆盖小分子药物早期研发从情报分析到合成性评估全链条，遵循药物发现底层逻辑，复刻研发科学家思路，完成高效小分子药物开发。

　　此次发布，是望石智慧在小分子药物研发领域AI能力价值转化的一次关键突破，更标志着公司迈出了从电子尺度向更广泛微观世界机制理解的重要一步。该智能体将加速小分子药物研发领域的数智化升级，并推动研发组织形态的变革。

　　望石智慧产品研发负责人付冬发布全新MolVortex

　　研发的核心是持续的科学决策闭环

　　创新药物发现是一场循环往复的科学决策闭环。一次科学发现的起点，通常来源于研发人员的观察与假设，再设计候选，用合适的方法评估，决定下一步行动，进入实验，并把结果回传下一轮观察。

　　因此，创新药研发不能止步于单点的计算或预测。长期以来，AI工具更多扮演“AI Assistant”的角色，擅长执行指令，如整理文档、安排计划等，大多停留在“助手”层面。而药物研发需要依据研发人员分析结果、做判断，并对下一步负责。尽管AI工具能够高效完成单点任务，但其无法辅助科学家完成一次完整的决策循环。

　　过去，这个决策闭环完全依赖科研人员手动串联。文献、专利、结构数据、实验结果分散在不同系统和工具里，每一轮循环，科研人员都要消耗大量时间在信息整理、工具操作、数据对齐上，导致这极大地占用了他们真正用在核心科学判断上的时间和精力。

　　跨领域专家联合开发，打造可解释、可信任、可追溯的专家级智能体

　　在此背景下，望石智慧以搭建能够辅助药物研发决策、开箱即用的专家级智能体为出发点，推出全新小分子医药早研智能体MolVortex。该平台以多智能体协同架构为核心，以决策罗盘为全链路数据底座，助力药物研发团队将研发目标、行动与证据组织成可持续迭代的系统，构建小分子药物研发新范式。

　　MolVortex是交叉学科智慧结晶。过去数年，望石智慧内部调动人工智能、计算化学、药物化学等跨学科专家联合攻坚，将药物研发真实思维链条融入产品设计，使产品紧贴真实药物研发流程与需求。

　　平台搭载20余个专业智能体。接到研发需求后，MolVortex作为“首席科学家”，动态组合多个可复用的专业智能体，自动集结情报智能体、分子设计智能体、结构模拟智能体等子Agent推进研发，贯通药物早期研发从药研情报收集分析、专利与文献智能解析、SAR与研发决策分析、分子生成与优化设计、亲和力与口袋分析、合成性与成药性评估全流程，让数据、模型和专家判断在同一个任务中协同合作。

　　期间，MolVortex能够自主完成从研发目标拆解、任务规划、多工具调度执行到结果校验交付的全流程，无需人工在不同工具和环节之间手动串联。其所输出的每一项方案都有据可依、有理可信，研发人员则根据证据链做出最终判断与决策，形成“Human-Data-in-the-Loop”闭环。

　　从电子层面探究第一性原理，整合垂直领域Know-How赋能药物研发

　　相较于通用型智能体，MolVortex更像一位拥有海量药物研发知识与Know-How的专家。

　　MolVortex底层融合了通用大语言模型，及望石智慧独家自研的一族模型——包括2D生成模型、多模态AI 3D分子生成大模型、基于电子密度的分子生成模型等。2022年，望石智慧在全球首次提出了基于实验电子密度的3D分子生成技术，并完成技术转化落地。其中，作为望石智慧分子生成主力模型，Lingo3DMol在与同类模型头对头的比较中，在活性分子复现率、分子-口袋结合打分、分子构象等关键指标上表现优于其他模型。

　　此外，实验电子云以真实电子云分布为训练信号，直接反映化学键、氢键、π-π 堆积等相互作用的物理本质，让望石智慧生成的分子能够从底层贴近物理真实，这一技术底座造就了MolVortex高效、精准的分子生成能力。

　　此前，基于Lingo3DMol开发的AI 3D分子生成平台MolVado已在数百个真实研发项目中沉淀海量Know-How，成为国内众多小分子药物研发企业和机构首选的AI制药平台。

　　目前，平台已接入近百个专业数据库，包含化学与药物、生物与基因组、疾病与临床、专利与监管及通用开源数据库。此外，依托望石智慧私有数据库，MolVortex还纳入了千万量级分子活性数据及复合物数据。

　　同时，MolVortex具备高度的灵活性和泛化能力，可以适配多种主流大模型，组合形成“意图理解+科学决策”的能力。其中，大模型负责理解研发意图，并将其翻译为专业模型可执行的指令，传达给专有模型;望石智慧专有模型负责分子生成与计算推演，完成完整早期研发链条的闭环。

　　首创决策罗盘，助力全链路数据沉淀及循证决策

　　针对AI“黑箱”带来的决策信任难题，MolVortex首创“决策罗盘”作为研发决策中枢。决策罗盘可以将药物早期研发全流程的所有节点数据、证据来源、实验结果、项目状态等自动沉淀为可追溯的研发证据与决策依据，且具备永久记忆能力。

　　通常来说，从情报检索、分子设计、结构模拟到成药性评估，药物研发各环节所面临的数据模态均不相同。MolVortex能够匹配各模态的数据格式，并无缝在线编辑，形成可交互的科学产物。

　　例如，在情报分析环节，MolVortex可以识别专利文献等文字内容，提取化合物结构等分子结构信息，在此基础上，数据流转至分子设计环节，研发人员可以继续在3D口袋上编辑口袋边界、定义相互作用位点、修改分子片段，这些编辑动作会被系统记录，并融入后续的推理与任务执行。当研发人员回传湿实验数据至MolVortex，平台能够在解析后，沉淀完整数据，反哺模型，加速自进化。

　　对于研发科学家而言，基于完整证据链，其能够对不同研发方案实现多维度评估与优先级排序，加速判断下一步最优行动(Next Best Action)，使决策更快推进目标;对于药物研发企业，决策罗盘能够为企业沉淀更多的认知资产和数据资产，助力私有数据库搭建。研发团队无需再在不同部门、不同系统之间来回同步信息、核对数据，通过决策罗盘就能获得全链路的统一决策视图。

　　引领下一代研发范式：药研、人力、组织的三重革新

　　此次MolVortex的推出，更代表着望石智慧对于未来研发范式趋势的预判。未来，以MolVortex为代表智能体将从研发工具延伸到研发方式：更高质的分子，让每一轮设计更接近目标;更专注的科学家，把时间还给判断与创意;更敏捷的团队，让组织由智能体赋能，推动更高效能的团队。

　　对于药物研发而言，MolVortex推动了评价标准的升级。研发团队不再只聚焦单个模型的精度指标，而是回归真实研发的核心维度。决策质量、样本效率、循环效率、目标达成度，最终指向一个目标：用更少的实验、更少的周期，推进到更好的分子。

　　对于研发团队而言，MolVortex为药化科研团队配备了更智能的外脑和一支自动化执行团队。药化专家无需精通复杂专业软件，可以通过语音语音直接调用原本需要跨部门协作的计算化学能力。

　　根据望石智慧内部评测结果，MolVortex能够在十几分钟内完成专利的活性数据提取、权利要求保护范围解析、上百分子的 SAR 构效分析与结合模式评估等跨部门重负荷工作。相比传统多个工具拼接流程，基于MolVortex进行分子设计，能够在1小时内批量获得数百个结构新颖、高质量化合物，效率相较传统模式提升70%。从高质量HIT(苗头化合物)发现到PCC(临床前化合物)的整体推进速度最高缩短约90%。

　　对于组织而言，MolVortex所代表的研发新范式，将有望推动制药企业组织进化与革新。原有模式下药化、CADD、IT 之间层层传递需求的链条被打破，研发团队从“按职能分工”转变为“按任务协同”，围绕同一个研发任务与最终产出协同，组织不必再为层层传递配置中间岗位，管理和团队搭建成本随之下降。

　　望石智慧MolVortex成为云栖大会展台区域焦点

　　依托MolVortex，望石智慧正在持续向横、纵双向延伸。横向包括覆盖如小核酸、多肽、材料分子、香料香精分子等更多模态的研发工作流，打造覆盖科学研发全周期的物理AI基础设施。纵向，实现跨尺度的突破，升级至由微观分子世界模型支撑的智能体平台，深入因果机制研究，从电子尺度出发建立对分子世界的理解，为更广泛的科学发现打开新空间。

　　目前 MolVortex已全面开放试用，扫描二维码即可免费申请。

　　与望石智慧携手探索智能体驱动的新药研发范式!

　　关于望石智慧

　　ABOUT STONEWISE

　　望石智慧(StoneWise)成立于2018年，是一家全球领先的基于人工智能技术驱动创新药物研发的科技公司，致力于为AI制药行业打造基于智能体的研发基础设施。

　　公司建立了行业首个以药物化学家决策链为基础的全流程新药设计智能引擎。依托独家沉淀、治理的药物研发数据资产及多模态AI 3D微观分子世界模型，望石智慧构建了小分子AI药物设计平台MolVado与医药早研智能体MolVortex，融合百万级虚拟化合物库，干、湿结合助力药物早期研发。

　　目前，公司已为国内外上百家药企、科研机构等提供覆盖分子生成与设计、定制化模型训练、化合物筛选等产品与服务。依托该智能引擎，公司已沉淀十余条自研管线，部分已进入临床试验阶段。